MRS 3.0.1, Sistema de indexado y búsqueda en bases de datos.
Acceda al paquete EMBOSS (4.1.0) usando wEMBOSS 1.7.1
SMS, visualización y análisis
de estructuras moleculares
MEME - MAST Versión 3.5.3, descubrimiento de motivos en grupos de
secuencias relacionadas de DNA o proteínas. Búsqueda en bases de datos de secuencias usando motivos .
SeWeR, análisis de
secuencias utilizando recursos web
Staden, paquete de
programas para ensamble de contigs (sólo
accesible via terminal X)
Consed, paquete de
programas para ensamble de contigs (sólo
accesible via terminal
X)HMMER,
análisis de secuencias utilizando Modelos Ocultos de
Markov (Acceda desde wEMBOSS o via
terminal X) ClustalW, alineamiento múltiple de secuencias (Acceda desde wEMBOSS o
via terminal X) PHYLIP, paquete de programas para análisis
filogenético (Acceda desde wEMBOSS
o via terminal
X) MEME, descubrimiento de motivos en un grupo de
secuencias relacionadas de DNA o proteínas (Acceda desde wEMBOSS o
via terminal
X)PredictProtein,
predicción de estructuras de proteínas Moldy, asistente de dinámica
molecular y modelado de proteínasProtein Explorer, visualiza estructuras 3D
de macromoléculas: proteínas, DNA y RNA y sus
interacciones y uniones con ligandos, inhibidores y drogas.TINKER,
paquete de programas para modelamiento molecular. (sólo accesible via terminal X)